在内容安排上，《中华人文自然百科:科技卷》采用大类、小类和词条三层结构，其中大类包括天文学、数学、医学和农学等，小类包括二十四节气、珠算、现代物理和信息技术等，词条包括日食、指南针、卫星和张衡等。此外，有两点要在此加以说明：一是对于年代的表示，《中华人文自然百科:科技卷》主要采用公元纪年法，但为了简便以及符合人们的使用习惯，56年实际指公元56年，1949年实际指公元1949年；二是书中将使用“古代”和“现代”两个概念，其中，古代指1911年清代灭亡以前，现代主要指1949年中华人民共和国成立以后。