《经济效益审计》共十二章，分为两部分：经济效益审计的理论，包括基本理论、审计程序的特点和审计评价标准三章；经济效益审计的实务，包括宏观经济效益审计实务、企业微观经济效益审计实务、项目微观经济效益审计实务和非经营性组织经济效益审计实务。