《金圣叹评点经典古文》注释方面，未给评点中的疑难字词作注，只注原文并力求简洁。编排上，为便于读者阅读，对原文、批点、注释分别用不同的字号、字体进行区分，同时将注释列为原文之右。根据《金圣叹评点经典古文》的实际内容，以突出金圣叹编选和批评的重要性。