2555年，距离爆发于00基地的生死之战已过去两年，三十年来人类对抗强大星盟的血腥战争已画上句号。传奇英雄士官长在重创方舟——这座先行者造于银河系外的宏伟天体之后，不知所终。人类与精英在历经战争创痛后维系着脆弱的和平。 在一次双方共同发起的惊心动魄的远征中，一个足以在短短数周内决定银河命运的先行者未解之谜重现天日。为了探究隐藏在这些危险谜团背后的真相，一支仓促组建的英勇的人类-精英团队必须求同存异，秘密重返方舟……而等待他们的，除了方舟的绝世惊艳与神秘莫测，更有黑暗之中蛰伏已久的致命威胁……