在凉宫春日系列前9卷故事中登场的神秘外星人、超能力者和未来人，此番再次出现在阿虚面前，而隐藏在他们身后的秘密也渐渐明朗。长门病倒的原因到底是什么？而神秘人物的最终目的又是什么？老同学轮番登场，时隔这么久不见，他们如今是敌是友？阿虚要如何判断，要如何拯救SOS团将面临的巨大危机？