《燕园珍藏》主体分为四部分。开篇首章为“历史的记忆”，主要展示北大百余年历史变幻中校史与校园的重要印迹。第二章为“智慧的传承”，意在记录这片土地上不同领域的学者们对人类知识边界与高度的挑战与贡献。第三章是“自然的馈赠”，精选燕园所珍藏的大自然的遗存与恩赐。很后一章为“文明的守护”，是中华文明与文化千百年来沉淀于燕园土地上一些具有代表与特色的呈现。 全书每一部分均是图文并茂，中英文并举。所有文字内容均是邀请相关领域学者专家撰写审定，把北大珍藏的“天、地、人”瑰宝汇集成一本册子，以展现这所百年学府的底蕴与魅力。