《基因论》全面阐述了摩尔根的染色体遗传理论，其内容包括遗传学的基本原理、遗传的机制、突变的起源、染色体畸变、基因和染色体在性别决定方面的作用等。本书不但总结了摩尔根小组自己的遗传研究成果，而且对当时已经发现的重要遗传学现象都做出了解释，是孟德尔—摩尔根学派观点的系统展现，其理论是遗传学发展史上的一次大飞跃。