《四圣心源》阐发《内经》、《难经》、《伤寒论》、《金匮要略》诸书蕴义。是一部包括中医基本理论和部分临床医学的综合性著作。黄元御按自己的\"之\"字治学方法，从黄帝、岐伯、张仲景和秦越人的医学观点出发，撰写一部进一步阐明《伤寒论》内在含义的著作。他的学术思想源于\"四圣\"，对脏府病理、生理的认识，重视脾胃中气的升降合宜。他指出:\"人与天地相参也。阴阳肇基，有祖气，祖气者，人之太极也。\"他认为脏气的升降功能都取决于中气，因此，主张\"中气之治\"。