《青云女仵作》讲述了青云朝京都丞相府的大小姐柳蔚，因庶出的身份与母亲身世的缘故，在家族中备受冷落，更因家族利益的需要而被强行许配给七皇子权王容溯。追求自由与个性的柳蔚在逃婚过程中，却误打误撞与三皇子容棱在短暂且不太愉快的相遇后分开。五年后，女扮男装的大仵作柳蔚，带着可爱的儿子柳小黎，以专业的手法破解了各种冤假错案，名重一时。柳蔚因此受邀进京协助镇格门都尉容棱破解大案。两人在经受众多磨难之后，不仅破解了系列悬案，彼此之间也了解渐深。而有关柳蔚的身世之谜，也逐渐揭开……