任性而孤僻的小女孩玛丽成了孤儿，由一位亲戚收养。她无意中发现了一个被废弃的秘密花园，便与小伙伴迪肯、柯林一起，在花园里种植各种花草，与狐狸、羊羔、乌鸦、知更鸟等动物做好朋友。渐渐地，她学会了友爱待人，恢复了纯真快乐的天性。